GLP计算合规标准 大分子研发咨询热线:400-820-9177 技术协作邮箱:[email protected]
计算节点集群:在线运行
● 计算生物学与大语言模型突破

高通量首页|J9国际集团中国官网网站与从头智能设计系统

融汇生成式生物深度学习模型与全原子物理能量场仿真,实现靶向大分子、特异性工程酶及复杂蛋白质构象的快速重构。全流程压缩研发筛选周期,突破亲和力与热稳定性极限,驱动生物制药与合成工业的工程化创新。

大分子构象动态推演引擎 v4.2 PRO
首页|J9国际集团中国官网网站构象分析三维示意图
< 1.25 Å 主链构象预测 RMSD 误差
1012 虚拟序列拓扑空间遍历
首页|J9国际集团中国官网网站底层计算架构图示
全栈自研算法矩阵
覆盖序列生成、构象折叠与自由能扰动计算

AI驱动的蛋白质工程计算底座

平台依托自研生成式几何深度学习网络,深度融合晶体衍射、冷冻电镜结构数据库与真实动力学轨迹。针对复杂抗原表位与严苛催化微环境,系统能够在原子尺度上精准预测主链构象及侧链旋转异构态,为湿实验提供高命中率突变体候选库。

  • ✓
    多尺度物理能量函数:兼容经典分子力场与量子化学修正项,严控折叠自由能变化。
  • ✓
    高精度构象解析:在盲测结构基准评测中保持中位数 RMSD < 1.5Å 的亚埃级精度。
  • ✓
    工业化流水线集成:直接对接高通量表达载体设计,数据流标准符合合规审计规范。
了解核心计算产品

六大核心计算维度重塑大分子设计

结合预训练模型对进化约束的深层解析,全面平衡结合活性、表达溶解度、耐热性与体内稳定性等多重生物物理指标。

01

从头分子设计 (De Novo)

基于目标靶标口袋几何特征,逆向生成全新拓扑骨架蛋白,摆脱天然模板依赖,开辟全新专利大分子化学空间。

02

亲和力多级优化网络

结合自由能扰动与界面接触图注意力机制,快速筛选结合亲和力提升10倍至100倍的关键协同突变位点组合。

03

热稳定性分子加固

识别疏水核心空腔并设计二硫键与盐桥网络,在维持催化活性的前提下使熔解温度(Tm)显著提升8-15℃。

04

免疫原性先验规避

内嵌MHC结合亲和力评估模型,早期扫描并剔除潜在T细胞表位,降低候选生物大分子的临床免疫原性风险。

05

高通量湿实验闭环验证

计算设计与自动化液体处理工作站无缝联动,实现双向参数校准,模型预测准度随数据沉淀实现持续强化迭代。

06

催化酶定向智能进化

对活性中心过渡态实施约束性动力学模拟,为工业生物催化剂开发提供高选择性、耐有机溶剂突变策略。

首页|J9国际集团中国官网网站核心产品线

围绕生物制药大分子开发与工业绿色催化需求,提供模块化算力产品与定制化解决方案支持。

靶向抗体智能设计工作站 治疗性抗体

抗体靶向设计工作站

专用于单抗、双特异性抗体及纳米抗体的CDR环区从头建模与亲和力成熟设计,支持全人源化改造与成药性综合评估。

14 天内
突变设计周期
发起对接
工业催化酶智能重构系统 工业生物催化

工业催化酶智能重构系统

针对手性合成、降解塑料水解酶及精细化工合成酶,实施催化效率(kcat/Km)放大与耐极端pH/高温重构计算。

3~5 倍
催化常数预期提升
发起对接
微生态合成蛋白质设计工具包 合成生物学

微生态合成蛋白质工具包

涵盖重组胶原蛋白、新型抗菌肽以及细胞外支架蛋白的多聚组装设计,重点解决高密度发酵下的分泌表达难题。

> 85%
可溶性表达达标率
发起对接

生成式生物智能与物理能量函数双驱动

单纯依靠数据驱动的黑盒模型容易受限于已知天然蛋白质数据分布。我们将量子物理约束作为损失函数的不可逾越边界,确保计算输出的不仅在统计学上合理,更能严格遵守热力学与立体空间位阻规律。

冷冻电镜结构高保真重合

针对未知折叠态靶标,计算模型与真实冷冻电镜重构云图的对齐度达到同业顶尖水准。

● 运算监控矩阵:大分子能量最小化分析 状态:收敛达成
界面氢键与盐桥优化匹配度 98.4%
表面疏水斑块规避指数(成药性相关) 94.1%
突变后熔解温度预测精度(ΔTm < 2℃) 91.7%
> RUN_JOB_0921: Target_Affinity_Score: -14.2 kcal/mol
> STATUS: Backbone validated against standard PDB reference. RMSD: 0.98Å.

创新药企与合成工业落地实录

直面传统分子改造中通量受限、假阳性率高、周期冗长的痛点,以实测数据验证AI算法工程化的确定性。

某港股上市创新药企 · 靶向肿瘤抗体项目

双特异性抗体低结合力表位亲和力优化

针对常规噬菌体展示文库无法富集的难成药浅口袋抗原,平台构建了定制化侧链柔性空间计算模型。在仅合成50个变体分子的湿实验条件下,成功筛选出KD值从微摩尔级别跃升至纳摩尔级别的强效突变体。

成效指标 亲和力提升42倍,结合特异性保持100%,项目从立项至候选分子确认仅耗时38天。
某生物制造领军企业 · 绿色催化酶工业化

嗜热脂肪水解酶耐受极限与催化速率改造

原始酶在65℃连续反应体系中半衰期不足4小时,严重制约量产放大。平台算法定位了三处柔性环区,重新规划内部疏水核心堆积并引入配对半胱氨酸网络,在维持活性口袋构象的同时极大地提升了蛋白质骨架刚性。

成效指标 耐受半衰期延长至48小时以上,反应单耗成本降低65%,顺利完成万升发酵放大。
120+
产业级交付大分子项目
88.5%
湿实验突变体初筛命中率
65%
平均设计研发周期缩减比
100%
客户知识产权独家归属率

业界研发科学家的实际反馈

来自全球一线药物化学家与蛋白质工程专家的实测使用体会,印证计算科学在湿实验闭环中的价值。

“过去针对膜蛋白口袋的亲和力成熟往往依赖多轮漫长的易错PCR与文库淘选,常常面临假阳性。通过该平台的能量函数修正,我们在首批交付的30个候选分子中就直接获得了理想的突变株,极大加速了IND申报进程。”

张博
大分子药物研发负责人

创新生物药研发中心

“从头设计全新折叠拓扑一直被视为理论界的探索,但该平台在酶工程领域的改造实践彻底改变了我们的认知。设计的酶分子在热稳定性和可溶性表达方面展现了罕见的鲁棒性,工业放大表现非常稳定。”

林总
合成生物事业部首席技术官

工业生物制品集团

“计算预测与冷冻电镜实测结构的重合度令人惊艳。更重要的是,平台给出的不仅是一个突变结果,还提供了清晰的能量变化贡献拆解,使得我们能够深刻理解大分子的结合机制与构象变化动态。”

陈研
结构生物学实验室主管

高新前沿转化医学研究院

首页|J9国际集团中国官网网站学术与工程前沿洞察

紧密追踪大分子深度学习算法、蛋白质-配体动态相互作用以及深度突变扫描领域的最新技术进展。

扩散生成模型在蛋白质骨架生成中的演进
前沿学术快报

扩散生成模型在大分子骨架设计中的最新迭代

探讨连续扩散模型如何突破传统离散自回归序列的局部极小值束缚,生成具有高度对称性与多聚组装特征的复杂拓扑结构。

深度突变扫描与高通量湿实验联动
工程落地洞察

深度突变扫描(DMS)赋能算法闭环的工艺解析

结合微流控液滴分选技术,单次实验获取十万级突变体活性标签,为AI预测模型提供高信噪比的微调基准数据集。

冷冻电镜构象动态与分子对接预测
生物计算指南

从静态晶体结构向动态构象系综的范式迁移

解析如何通过增强采样动力学模拟捕捉蛋白质活性口袋的隐蔽开闭状态,为难治靶点的药物发现开辟新维度。

首页|J9国际集团中国官网网站核心技术问答

针对研发团队关切的湿实验成功率、私有化环境部署、罕见靶点建模及知识产权归属等关键问题提供明确说明。

若计算设计的突变体在湿实验中未测出活性,有何后续保障? +
我们实施严格的研发闭环保障机制。若首轮由算法推荐的高潜突变体在湿实验验证中活性未达约定标准,平台将立即调取该批次实验反馈的阴性数据对物理能量场进行再平衡校准,免费为客户发起二级约束条件下的重新筛选与优化计算,直至候选序列进入达标区间。
平台针对缺乏同源模板或冷冻电镜数据的孤儿靶点是否具备设计能力? +
完全具备。自研的从头生成算法并非单纯匹配现有PDB同源模板,而是基于氨基酸残基间的相对空间几何先验与自由能最小化规律展开逆向从头折叠。针对罕见抗原或无同源结构的新型催化酶,平台可直接依托初始结合微环境生成全新的结合骨架。
合作项目产出的蛋白质序列、三维构象及突变方案专利归属于谁? +
客户享有100%完全独立且不受限制的知识产权。项目正式开展前双方签署严格的保密协议(NDA)。计算生成的所有分子序列、拓扑模型、突变库数据以及后续衍生专利申请权利均全额归客户方独家所有,我们仅提供计算技术服务支持。
制药企业能否申请私有化本地算力集群部署以确保核心管线安全? +
支持。针对有严格数据物理隔离合规要求的大型制药企业或科研院所,我们提供企业级私有化交付方案。平台算法流水线可完整部署至客户内部GPU计算中心,支持内网离线计算与本地高通量实验设备直连,杜绝任何数据外泄风险。
常规抗体亲和力优化或酶耐热性改造项目的完整计算交付周期是多久? +
在靶标构象与明确约束条件齐备的前提下,常规项目的AI拓扑空间搜索、能量优化及虚拟筛选通常在10至15个工作日内完成交付。我们最终将向客户输出包含20-50个核心候选突变体的详细评分报告、位点突变机理解释及合成推荐清单。
🔒
物理级数据隔离

全流程端到端数据传输加密,算力容器动态独立销毁,严密保障研发管线商业机密。

📜
知识产权独家归属

合同前置明确专利独占权益,平台绝不主张任何大分子发明专利的共有权利。

⚙️
标准合规文档输出

交付数据格式严谨对接GLP实验体系与国际IND申报计算模型审查规范要求。

🤝
专家组全周期伴随

由资深结构生物学博士与算法架构师全程参与分子设计方案评审与实验指导。

开启高效精准的智能蛋白质工程

摆脱高成本盲目试错,依托领先的计算生物学底座加快候选分子验证步伐。填写您的具体研发需求,我们的生物计算科学家将在24小时内与您取得联系并提供初步技术评估建议。

  • ✔ 签署正式双向保密协议(NDA)后开展技术细节交流
  • ✔ 免费提供初步靶点构象评估与成药性/稳定性可行性报告
  • ✔ 灵活匹配云端SaaS调用、专属定制计算或私有化部署模式